Il Corso non prevede propedeuticità. Tuttavia, ai fini di un più proficuo apprendimento di alcuni contenuti del corso sono necessarie le conoscenze di base acquisite durante la triennale riguardo la microbiologia e conoscenze riguardo alla genetica, alla biologia molecolare e alla biochimica. 

Il corso ha come obiettivo fornire le competenze necessarie per eseguire analisi omiche su microrganismi. I temi principali affrontati includono: l'utilizzo delle tecnologie omiche per lo studio di microrganismi in coltura pura, l'analisi delle comunità microbiche, la genomica comparativa e l'analisi struttura-funzione di proteine e complessi proteici. Oltre alle basi teoriche, il corso mira a sviluppare competenze pratiche per la gestione di dataset di grandi dimensioni e l'esecuzione di analisi in silico mediante strumenti e script disponibili in modalità open access.

Al termine del corso, lo studente sarà in grado di:

• Progettare autonomamente esperimenti che includono analisi omiche (genomica, genomica comparativa, trascrittomica e proteomica)
• Gestire e processare dataset di grandi dimensioni derivati da analisi omiche
• Utilizzare i principali strumenti bioinformatici per l'analisi in silico di dati omici

Al termine del corso, lo studente sarà in grado di integrare le competenze omiche con gli esperimenti di laboratorio in un approccio multidisciplinare

Il corso si basa su una doppia metodologia didattica. Gli strumenti teorici saranno forniti dal docente attraverso lezioni frontali, mentre le attività pratiche saranno organizzate secondo approcci di cooperative learning, con l'obiettivo di sviluppare negli studenti capacità di analisi critica e competenze trasversali.

La valutazione degli studenti è effettuata mediante prova orale. E’ mirata ad accertare, in misura proporzionale:
- Il livello delle conoscenze teoriche acquisite, attraverso la presentazione di argomenti del programma (50%)
- Il livello delle abilità pratiche acquisite, attraverso la descrizione di metodiche e metodologie (25%)
- La capacità di applicare le conoscenze teoriche e le abilità pratiche acquisite alla soluzione di problemi (25%)

Utilizzo delle tecnologie omiche per lo studio dei microrganismi:
Gianni Dehò, Enrica Galli, Paolo Landini, Marco Ventura
Biologia dei microrganismi

Approcci di bioinformatica:

Manuela Helmer Citterich, Fabrizio Ferrè, Giulio Pavesi, Graziano Pesole, Chiara Romualdi

Fondamenti di bioinformatica